Whole Transcriptome Analysis of the Mouse Placenta Following Radiation-Induced Growth Restriction
Notice bibliographique
Résumé
High doses of ionizing radiation during prenatal development can cause growth restriction, or a decrease in growth of the developing offspring. This outcome of intrauterine growth restriction (IUGR) can predispose the offspring to lifelong health outcomes, which is referred to as developmental programming. The role of the placenta in radiation-induced IUGR was investigated using a mouse model. Pregnant BALB/cAnNCrl mice were externally irradiated with 1.82 Gy x-ray irradiation on gestational day 14.5. Fetoplacental units were collected on gestational day 18.5, and growth restriction was observed in irradiated offspring. Whole placenta samples from growth restricted and sham-irradiated groups were analyzed via RNA-sequencing analysis. Differential gene expression (DEG) analysis revealed a total of 166 DEGs in the irradiated samples. Validation of these DEG findings were completed using RT-qPCR analysis. Gene ontology (GO) analysis of the DEGs supported the involvement of autoimmune response and dysregulation in retinol (vitamin A) metabolism in the placenta. Upstream prediction analysis identified a number of potential regulators responsible for the DEG profiles including Nppb, Myod1 and genes of the classic complement system (Complement C1q chains C1qa, C1qb, C1qc). Overall, these findings present an overview of the dysregulation in the mouse placenta following an acute, high-dose radiation exposure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».