Bacterial Microbiota in Soil Amended with Deoxynivalenol-Contaminated Wheat
Notice bibliographique
Résumé
Feed contaminated with the mycotoxin deoxynivalenol (DON) can negatively impact livestock health and performance. Bacteria capable of degrading DON present a method of mitigating its harmful effects. This study aimed to identify microbial consortia from soil samples that could degrade DON. Soil from central (Lacombe, LA) and southern (Lethbridge, LE) Alberta were used as microbial inoculant. The soils were mixed with DON-contaminated wheat (18 ppm/kg) on day 0, and each soil type was divided into triplicate pots (180 g) and placed in a controlled environment for 32 d. Control pots of each soil type were included, which contained no DON-contaminated wheat. On days 0, 7, 14, and 32, 1 g subsamples were collected from pots, serially diluted in a limited medium containing DON (10 µg/mL) as the only carbon source, and incubated for 2 weeks (30 °C). DNA was extracted from the pots across time, as well as the subsample consortia grown in DON-amended medium, and was analyzed for bacterial changes after 16S rRNA gene sequencing. The relative abundance of bacterial genera in soil samples after enrichment with DON-contaminated wheat increased across time compared to the baseline day 0 time point. DON-degrading activity (26%) was only detected in LA soil suspension on day 7, and was highest after 14 days of incubation. The most abundant bacteria in the LA DON-degrading consortia belonged to the Pseudomonas (8.8%), Delftia (7.4%), Acinetobacter (6.4%), Comamonas (5.7%), Stenotrophomonas (5.5%), Shinella (5.5%), Ensifer (5.1%), Agrobacterium (5.0%), Achromobacter (4.7%), and Rhizobium (3.7%) genera. Pseudomonas aeruginosa (n = 9) and Serratia liquefaciens (n = 3) strains isolated from the LA consortia did not degrade DON. Overall, this study shows that the soil contained bacteria capable of degrading DON; however, variation existed depending on the soil’s source.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».