Entire project-raw mass spectrometry data of the positive protein spots (band 1-4).
Notice bibliographique
Résumé
Background: Mimiviruses or giant viruses that infect amoebas have the ability to retain the Gram stain, which is usually used to colour bacteria. There is some evidence suggesting that Mimiviruses can also infect human cells. Guided by these premises, we performed a routine Gram stain on a variety of human specimens to see if we could detect the same Gram positive blue granules that identify Mimiviruses in the amoebas. Methods: We analysed 24 different human specimens (liver, brain, kidney, lymph node and ovary) using Gram stain histochemistry, electron microscopy immunogold, high resolution mass spectrometry and protein identification. Results: We detected in the human cells Gram positive granules that were distinct from bacteria. The fine blue granules displayed the same pattern of the Gram positive granules that diagnose Mimiviruses in the cytoplasm of the amoebas. Electron microscopy confirmed the presence of human Mimiviruses-like structures and mass spectrometry identified histone H4 peptides, which had the same footprints as giant viruses. However, some differences were noted: the Mimivirus-like structures identified in the human cells were ubiquitous and manifested a distinct mammalian retroviral antigenicity. Conclusions: Our main hypotheses are that the structures could be either giant viruses having a retroviral antigenicity or ancestral cellular components having a viral origin. However, other possible alternatives have been proposed to explain the nature and function of the newly identified structures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,033 | 0,063 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».