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Enregistrement W4416610765 · doi:10.5256/f1000research.20788.r51586

Referee report. For: Human aldose reductase unfolds through an intermediate. [version 1; peer review: 3 approved with reservations]

2019· article· en· W4416610765 sur OpenAlexfundno aff
Yong‐Bin Yan

Notice bibliographique

RevueFaculty of 1000 Research Ltd · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAldose Reductase and Taurine
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsCentre National de la Recherche ScientifiqueInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésAldose reductaseMutationEnzymeDiabetes mellitusDrug

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Human aldose reductase (hAR) converts glucose to sorbitol under hyperglycemic conditions. Aldose reductase is first and rate limiting enzyme of polyol pathway. Under hyperglycemia, increased flux of glucose through this pathway has been implicated in development of secondary complication in diabetes. Due to this clinical implication, aldose reductase attracted considerable attention from drug discovery perspective. In spite of extensive characterization of the biochemical and structural context, little is known about the unfolding behavior of aldose reductase. This study reports equilibrium unfolding studies of human aldose reductase. Methods: We carried out thermal and chemical induced equilibrium unfolding studies of human aldose reductase monitored by circular dichroism and tryptophan and ANS fluorescence spectroscopy. Results: Thermal unfolding studies present a classical picture of two state unfolding from native to unfolded state. The data was used to derive thermodynamic parameters and study thermostability of aldose reductase. Urea and GuHCl induced equilibrium unfolding studies led us to discover an intermediate state, which gets populated at 3.5-4.0 M and 0.7-2 M of urea and GuHCl, respectively. Thermodynamic parameters from chemical induced unfolding are in agreement with those obtained from thermal unfolding. Conclusion: This study revealed that aldose reductase unfolds from native to unfolded state via an intermediate. Assessment of thermodynamic stability of native, intermediate and unfolded state shows that three states are separated by significant energy barriers that ensure cooperativity of unfolding. As hAR functions in cells which are under osmotic and oxidative stress, these in vitro findings may have implications for its native conformation under physiological state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,072
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,554
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,072
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0040,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0090,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,5540,392

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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