Referee report. For: Multidrug-resistant Campylobacter jejuni, Campylobacter coli and Campylobacter lari isolated from asymptomatic school-going children in Kibera slum, Kenya [version 2; peer review: 1 approved, 1 approved with reservations]
Notice bibliographique
Résumé
Background: The objective of this study was to determine the prevalence of thermophilic Campylobacter spp. in asymptomatic school-going children and establish the antibiotic resistance patterns of the isolates towards the drugs used to treat campylobacteriosis, including macrolides, quinolones and tetracycline. Campylobacter spp. are a leading cause of enteric illness and have only recently shown resistance to antibiotics. Methods: This study isolated Campylobacter spp., including Campylobacter coli , Campylobacter jejuni and Campylobacter lari , in stool samples from asymptomatic school-going children in one of the biggest urban slums in Kenya. The disc diffusion method using EUCAST breakpoints was used to identify antibiotic-resistant isolates, which were further tested for genes encoding for tetracycline resistance using primer-specific polymerase chain reaction. Results: In total, 580 stool samples were collected from 11 primary schools considering both gender and age. Subjecting 294 biochemically characterized Campylobacter spp. isolates to genus-specific PCR, 106 (18.27% of stool samples) isolates were confirmed Campylobacter spp. Out of the 106 isolates, 28 (4.83%) were Campylobacter coli , 44 (7.58%) were Campylobacter jejuni while 11 (1.89%) were Campylobacter lari . Campylobacter jejuni had the highest number of isolates that were multi-drug resistant, with 26 out of the 28 tested isolates being resistant to ciprofloxacin (5 mg), nalidixic acid (30 mg), tetracycline (30 mg) and erythromycin (15 mg). Conclusions: In conclusion, asymptomatic school going children in the study area were found to be carriers of multidrug resistant Campylobacter coli , Campylobacter jejuni and Campylobacter lari at 84%. A one-health approach, which considers overlaps in environment, animals and human ecosystems, is recommended in addressing multidrug resistane in Campylobacter, since animals are the main reservoirs and environmental contamination is evident.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,054 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,009 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,362 | 0,127 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».