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Enregistrement W4416633866 · doi:10.5256/f1000research.151380.r219458

Referee report. For: A cross-sectional audit and survey of Open Science and Data Sharing practices at The Montreal Neurological Institute-Hospital [version 1; peer review: 1 approved with reservations, 1 not approved]

2023· article· en· W4416633866 sur OpenAlexfundaboutno aff
Felix Nikolaus Wirth

Notice bibliographique

RevueFaculty of 1000 Research Ltd · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMontreal Neurological Institute and Hospital
Mots-clésAuditOpen scienceData sharingOpen dataPeer reviewPeer-to-peer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Open science is a movement and set of practices to conduct research more transparently. The adoption of open science has been recognized to support innovation, equity, and transparency. The Montreal Neurological Institute-Hospital (Neuro) has committed to becoming an ‘open science’ institute, the first of its kind in Canada. Here we report on an audit of open data practices in Neuro publications and on a survey of Neuro-based researchers’ barriers and facilitators to data sharing. Methods: In the first study, we retrieved 313 unique publications and collated all Neuro publications from 2019 and extracted information from each article pertaining to data sharing and other open science practices. We included all empirical papers and pre-prints that were reported in English. In the second study, one hundred twenty-four participants (out of 553) completed the survey, with a response rate of 22.42%. We surveyed all Neuro researchers. For the audit, we examined data sharing and open science practices. For the survey, we asked participants questions about their data sharing practices and perceptions. Results: We found that 66.5% of these publications (n=208) included a data sharing statement. Overall, 74.5% (n=155) of articles had data that was publicly available. When examining broader open science practices, rates of compliance tended to be lower. For example, 94.9% (n=297) of publications failed to register a protocol. Among participants who had published a first or last authored paper in the past year, most participants, 53 of 74 (71.62%), reported that they had openly shared their research data. Less than half of the participants, 37.50% (n=45), reported having engaged in training related to data sharing within the last 12 months. Conclusion: We found that half of all publications included in the audit shared data. Participants indicated an appetite for resources for learning about data-sharing signaling a willingness to perform better.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaMétarechercheScience ouverte
Domaine: Reproductibilité · Genre: Commentaire
Porte sur le système de recherche canadien: oui · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelmedium
gptMétarechercheScience ouverte
Domaine: Méthodes · Genre: Commentaire
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnelhigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,043
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,535
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,995
Score d'incertitude au seuil0,952

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0430,535
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,004
Bibliométrie0,0090,010
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0050,005
Intégrité de la recherche0,0140,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3320,149

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,834
Tête enseignante GPT0,611
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineReproductibilité · Méthodes
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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