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Enregistrement W4416634367 · doi:10.1183/13993003.congress-2025.pa5252

Late Breaking Abstract - Smoking and alcohol drinking increases the risk of bronchiectasis in CFTR p.Phe508del carriers

2025· article· W4416634367 sur OpenAlexaff
Simon Rousseau, Sahar Mikaeeli, Tomoko Nakanishi, Pei Zhi Li, Sirui Zhou, Jean Bourbeau

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcGill Genome CentreJewish General HospitalCentre for Advancing Health OutcomesMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBronchiectasisLogistic regressionOdds ratioBiobankAlcohol consumptionRisk factorCohort study

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

How CFTR variants interact with environmental exposures is key to identify risk factors for non-CF pulmonary diseases. We performed Protein Quantitative Trait Loci (pQTL) analyses to identify CFTR–protein associations, and linear regression to assess differences in expression across lifestyle subgroups. In UK Biobank (n=225,281), the associations between CFTR p.Phe508del heterozygosity, smoking and/or alcohol consumption on pulmonary outcomes were assessed using cox and firth logistic regression models stratified by exposure groups. In BQC19, (n=1,254), two CFTR-associated trans pQTLs were identified: rs60387136 (linked to PNLIPRP1) and rs1343830 (linked to PRSS2, REG3G, and CPB1). In UK Biobank (n=35,989), five trans-pQTLs were identified: rs10255917 (linked to PNLIPRP1); rs994997 (linked to CPA1, PRSS2, and CTRB1); rs214152 (linked to CPA1); and rs6466619 and rs4727851 (linked to CPB1). All pancreatic-associated proteins. CFTR p.Phe508del carriers had reduced plasma levels of CPA1, CPB1 and REG3A and increased risk and odds of bronchiectasis (HR=1.38, p=0.0038; OR=1.39, p=0.005). These associations were particularly strong in never smokers (bronchiectasis: HR=1.66, p=0.0016; OR=1.69, p=0.003) and very heavy drinkers (bronchiectasis: HR=1.59, p=0.019; OR=1.62, p=0.023). Among current smokers, heterozygosity was linked to increased bronchiectasis risk (HR=1.83, p=0.042; OR=1.90, p=0.046). Kaplan–Meier analyses showed earlier onset of bronchiectasis (p=0.0043) in carriers, especially in never smokers and very heavy drinkers. We identified altered levels of pancreatic enzymes in CFTR p.Phe508del carriers and an increased risk of bronchiectasis in current smokers and very heavy drinkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,075

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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