Exploring epithelial dysfunction in primary ciliary dyskinesia
Notice bibliographique
Résumé
Background: Primary ciliary dyskinesia (PCD) is a rare autosomal recessive disorder characterized by mutations in ciliary genes that cause a dyskinetic ciliary beat pattern. This results in impaired mucociliary clearance, recurrent infections, and progressive lung damage, culminating in bronchiectasis. Despite these clinical manifestations, the epithelial biology and inflammatory response in PCD remain poorly understood. Aim: To investigate the composition and transcriptomic profile of the airway epithelium in PCD using in vitro cell culture. Method: Nasal brush biopsies from PCD patients with a static cilia phenotype and healthy age/sex-matched controls were differentiated in air-liquid interface (ALI) cultures (n=9). Basal, ciliated, and mucosecretory cells were quantified using qPCR, flow cytometry, and histology. Bulk RNA sequencing was performed, and cytokine levels in culture supernatants were measured using ELISAs. Results: Following differentiation, high-speed video microscopy was used to confirm all PCD ALI cultures had static cilia. PCD cultures contained fewer basal cells than controls, demonstrating a distinct differentiation capacity of the PCD epithelium in vitro. Bulk RNA sequencing revealed differential expression of NOS2, and pathway enrichment analysis showed altered cell cycle, wound healing and phosphoinositide 3-kinase (PI3K) signalling pathways within PCD cultures. Conclusion: We provide an RNA sequencing dataset for PCD, identifying reduced NOS2, consistent with reduced nasal nitric oxide in patients. PCD epithelium exhibits distinct differentiation, suggesting potential implications for basal cell function within PCD. The implication of these differences remains to be determined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».