Interstitial lung disease: a 2-year-old child with ABCA3 deficiency treated by CFTR potentiators
Notice bibliographique
Résumé
Background: Pathogenic variants in ATP biding cassette A3 (ABCA3) gene can cause chronic interstitial lung diseases (ILD). As a lipid transporter involved in surfactant homeostasis, ABCA3 shares similarities with the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR). In vitro studies suggest CFTR potentiators may restore function of ABCA3 variants. We report a compassionate trial of CFTR modulators in a 2-year-old with ABCA3 deficiency. Method: Trio whole-genome rapid sequencing identified ABCA3 compound heterozygous variations supporting a diagnosis of ABCA3 deficiency (PRAGMatIQ study, Québec). After independent expert panel review (Respifil, France), a trial of CFTR modulation with elaxacaftor-tezacaftor-ivacaftor (ETI) was started (Trikafta, Vertex Pharmaceuticals). The SpO2/FiO2 (S/F) ratio was recorded for primary outcome. Results: Patient presented with failure to thrive, development delay, and progressive respiratory distress requiring PICU admission for continuous positive airway pressure with FiO2 40%-70%. Chest CT showed diffuse ground glass opacities, ILD workup was negative. Despite 10 weeks of standard treatment, he remained with hypoxic respiratory failure (median S/F ratio 380, IQR 338-411). Eight days after ETI initiation, respiratory support was gradually weaned as S/F ratio normalized (median 463; IQR 458-467; P<0.001). He was transferred to the ward at 17 days and discharged after 9 weeks. Conclusion: While confounding factors cannot be excluded, marked improvement with ETI may indicate ABCA3 functional rescue by CFTR potentiators. Residual gene function is likely given heterozygosity for a non-canonical splicing variant and the late clinical presentation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».