MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4416645852 · doi:10.1172/jci189830

Functional consequence of pathogenic GABRA3 variants determines whether X-linked inheritance is dominant or recessive

2025· article· en· W4416645852 sur OpenAlexaff
Katrine M. Johannesen, Khaing Phyu Aung, Vivian W. Y. Liao, Nathan L. Absalom, Han Chow Chua, Xuetao Gan, Miaomiao Mao, Chaseley E. McKenzie, Hian M. Lee, Sebastian Ortiz, Rebecca C. Spillmann, Vandana Shashi, Rodney A. Radtke, Ghayda Mirzaa, Patricia A. Weisner, Josue Flores Daboub, Caroline Hagedorn, Pinar Bayrak‐Toydemir, Desiree DeMille, Jian Zhao, Nandita Bajaj, Yline Capri, Boris Keren, Miriam Schmidts, Ingrid M.B.H. van de Laar, Marjon A. van Slegtenhorst, Rafał Płoski, Marta Bogotko, Danielle K. Bourque, Ebba Alkhunaizi, Lauren Chad, Nada Quercia, Houda Zghal Elloumi, Ingrid M. Wentzensen, Michael C. Kruer, Pritha Bisarad, Carolina I. Galaz-Montoya, Dominique Braun, Katie Angione, Camilo Espinosa-Jovel, Pia Zacher, Konrad Platzer, Samuel F. Berkovic, Ingrid E. Scheffer, Mary Chebib, Guido Rubboli, Rikke S. Møller, Philip K. Ahring

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoNewborn Screening OntarioChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilLundbeckfondenNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SMedical Research CouncilStiftung Michael
Mots-clésEpilepsyInheritance (genetic algorithm)Epilepsy syndromesCLARITYMultifactorial InheritanceGeneralized epilepsyGeneIntellectual disabilityPenetrance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disorders of GABRA3, the only epilepsy-associated GABAA receptor subunit gene on the X chromosome, have eluded clinical clarity due to ambiguous inheritance patterns and variable phenotypes. The long-standing assumption that all pathogenic variants cause loss of function further obscured genotype-phenotype relationships and hindered progress. Here, we curated a cohort of individuals with a GABRA3 variant, integrating deep phenotyping, genotyping, family history, and electrophysiology with a targeted mouse model. Among 43 individuals with 19 GABRA3 variants, functional analyses revealed gain- and loss-of-function effects, each linked to distinct clinical profiles. Gain-of-function variants were associated with severe, treatment-resistant epilepsy and profound intellectual disability, disproportionately affecting males, who were often nonambulant and had cortical visual impairment. Loss-of-function variants produced milder phenotypes, with epilepsy rarely observed; affected males showed behavioral issues and language delay, while females were unaffected carriers. Our gain-of-function (Gabra3Q242L/+) mouse model mirrored these sex-specific differences, showing increased seizure susceptibility, early death, and marked cortical hyperexcitability. These insights resolve longstanding uncertainties surrounding GABRA3 and redefine how X-linked disorders are interpreted. They demonstrate that it is the functional impact of a variant, not its mere presence, that determines whether a condition manifests dominantly or recessively. This distinction carries important implications for genetic counseling, precision medicine, and the broader interpretation of X-linked neurodevelopmental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical InvestigationMême sujetGenomics and Rare DiseasesTravaux en français237 207