Regulation of Alternative Polyadenylation Events by PABPC1 Affects Erythroid Progenitor Cell Expansion
Notice bibliographique
Résumé
Erythropoiesis is precisely regulated by multilayered networks. It is crucial for maintaining steady-state hemoglobin levels and ensuring effective oxygen transport. Alternative polyadenylation (APA) is a post-transcriptional regulatory mechanism generating multiple mRNA isoforms from a single gene based on specific 3' untranslated region sequences. While APA plays a vital role in various cellular processes, the underlying mechanism in erythropoiesis remains largely unexplored. In this study, we employed an integrative approach, combining bioinformatics analyses and experimental validations, to systematically investigate the role of APA in erythropoiesis. We mapped the APA landscape during erythroid differentiation and identified significant APA shifts essential for the differentiation of erythroid cells from burst-forming unit erythroid (BFU-E) to colony-forming unit erythroid (CFU-E). Notably, our findings highlighted polyadenylate-binding protein cytoplasmic 1 (PABPC1) as the primary regulator of APA during these stages. Functional analyses have revealed that knockdown of PABPC1 disrupts erythroid progenitor cell proliferation and differentiation. These results implicate an essential role of PABPC1 in modulating cell fate through APA regulation. Furthermore, we found that decreased PABPC1 levels increased the usage of the proximal polyadenylation sites in the TSC22 domain family member 1 (TSC22D1) gene. This shift led to elevated expression of TSC22D1, uncovering a novel mechanism by which APA influences erythroid progenitor expansion and differentiation. Our findings provide novel insights into APA regulation in early erythropoiesis and suggest potential therapeutic strategies for diseases associated with erythropoietic disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».