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Enregistrement W4416662792 · doi:10.1016/j.jbc.2025.110983

Neurodevelopmental disease-causing variants in choline kinase CHKA gene couple phosphatidylcholine synthesis to oxidative stress damage and disease etiology

2025· article· en· W4416662792 sur OpenAlexafffund
Mahtab Tavasoli, Mariam Alkandari, Gabriel G. Dorighello, Michael McPhee, Neale D. Ridgway, Stanislav Sokolenko, Reza Maroofian, Anju Shukla, Maha S. Zaki, Henry Houlden, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensAGADA BiosciencesDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésOxidative stressLipid peroxidationMissense mutationPhospholipidReactive oxygen speciesCholinePhosphatidylcholineMitochondrionEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biallelic variants in CHKA, which encodes the first enzyme in the CDP-choline pathway for the synthesis of phosphatidylcholine, cause an inherited disorder characterized by epilepsy, microcephaly, and intellectual disability. How a deficiency in CHKA activity manifests these neurological symptoms is poorly understood. In this study, we investigated patient-derived fibroblasts with CHKA missense variants to elucidate the molecular and biochemical mechanisms underlying the associated pathologies. CHKA variant fibroblasts exhibited impaired phospholipid and triacylglycerol synthesis, altered mitochondrial morphology and function, elevated reactive oxygen species (ROS) levels, and increased lipid peroxidation, suggesting a mechanism by which defective CHKA activity leads to lipid damage. Treatment with FCCP, a mitochondrial uncoupler, reduced ROS levels and attenuated lipid peroxidation in CHKA patient fibroblasts, suggesting a potential approach to therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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