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Enregistrement W4416664677 · doi:10.1101/2025.11.21.689804

Direct Measure of DNA Damage in Huntington Disease Reveals Elevated Oxidative Genotoxic Stress and Dysfunctional DNA Repair

2025· preprint· W4416664677 sur OpenAlexafffund
Carlos Barba Bazan, Samantha R Laville-Dupuy, Maya Klepfish, Jason Cousineau, Tamara Maiuri, Christina Peng, Elizabeth J. Osterlund, Melanie Alpaugh, Ray Truant

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of GuelphMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsKrembil Foundation
Mots-clésHuntingtinDNA damageDNA repairOxidative stressDNAMutantOxidative phosphorylationHuntington's disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract DNA damage repair (DDR) pathway proteins are genetic modifiers of Huntington disease (HD) age of onset and severity. Deficient DDR in HD at the first steps of poly ADP-ribosylation makes DNA damage quantification by traditional downstream DNA damage response markers inaccurate. Repair Assisted Damage Detection (RADD) allows for an accurate direct assessment of oxidative DNA damage, a DDR pathway in which huntingtin protein directly participates. Using RADD, we show that human HD-derived cells have elevated oxidative DNA damage and assess the effect of relevant HD therapeutic targets in rescuing this phenotype. Using huntingtin protein level lowering, we define a dysfunctional role of mutant huntingtin in oxidative DDR. We show that ataxia-telangiectasia mutated (ATM) signaling is deficient and that ATM inhibition rescues elevated oxidative DNA damage in HD cells. In contrast, we show that N6-furfuryladenine (N6FFA) treatment, to increase huntingtin phosphorylation within the amino terminal N17 domain (p-N17), is not effective at restoring HD DDR but reveals dysfunctional N6FFA mediated DDR signaling. We propose a model in which elevated DNA damage arises from both aberrant mutant huntingtin involvement in oxidative DDR and the impairment of oxidative DDR pathways, such as ATM kinase activity, N6FFA processing, and poly ADP-ribose signaling in HD. This highlights the importance of using direct measures of DNA damage such as RADD, rather than measures of a DNA damage response pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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