MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4416673529 · doi:10.1021/acs.jproteome.5c00616

Surface Proteomic Analysis Reveals the Presence of Noncanonical Cell Membrane Endoplasmic Reticulum Chaperones in High-Grade Gliomas

2025· article· en· W4416673529 sur OpenAlexaff
Alexis Z Minchaca, Jean B. Bertoldo, Philipp Graber, Dong-Hun Bae, Nisitha Jayatilleke, Chelsea Mayoh, Brett W. Stringer, Louise Ludlow, Maria Kavallaris, Angelica M. Merlot

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensRoyal Ottawa Mental Health Centre
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilTour de CureUniversity of New South WalesKids Cancer AllianceCancer Institute NSW
Mots-clésEndoplasmic reticulumCellMembrane proteinTranscriptomeChaperone (clinical)Unfolded protein responseCell membraneProteome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-grade gliomas (HGG) are highly aggressive tumors, which are predominately fatal for adults and pediatric patients. Identifying cancer-selective therapeutic targets remains a critical unmet need. The overexpression of endoplasmic reticulum (ER) chaperones in various cancers is well documented. Moreover, tumor cells exhibit an atypical surface expression of ER chaperones, suggesting the potential for selective targeting. Our study examined the differences in the mRNA, total protein, and surface expression levels of seven key ER chaperones, compared with those in non-neoplastic samples. Notably, a poor correlation was found between mRNA, protein, and surface protein levels, underscoring the limitations of transcriptomics alone in target discovery. We also highlight the limitations of surfaceome studies which exclude noncanonical membrane proteins, such as ectopically expressed ER chaperones, which often escape detection by conventional bioinformatic pipelines. For the first time, this study advances our understanding of the surface expression of ER chaperones in both adult and pediatric HGG. Our findings highlight the importance of surfaceome analysis in the discovery of cancer selective targets against this devastating disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,471

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Proteome ResearchMême sujetEndoplasmic Reticulum Stress and DiseaseTravaux en français237 207