Results from the Survey of Antibiotic Resistance (SOAR) 2018–21 in India: data based on CLSI, EUCAST (dose-specific) and pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD) breakpoints
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Antibiotic susceptibility determination of community-acquired respiratory tract infection (CA-RTI) isolates of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae were collected from India (2018-21). METHODS: MICs were determined by CLSI broth microdilution; susceptibility data were interpreted using CLSI, EUCAST and pharmacokinetic/pharmacodynamic (PK/PD) breakpoints. RESULTS: S. pneumoniae (n = 177) and H. influenzae (n = 171) isolates were collected from four hospital laboratories and two private laboratories in India. Only 41.2% pneumococci were penicillin susceptible by CLSI oral/EUCAST low-dose breakpoints, but 94.4% were susceptible by EUCAST high-dose/CLSI IV breakpoints. Good activity (≥89.8%, CLSI or PK/PD breakpoints) was observed for amoxicillin, amoxicillin/clavulanic acid, cefotaxime, ceftriaxone, levofloxacin, and moxifloxacin. Cefdinir and second-generation cephalosporins were less active (27.7%-64.4%). Tetracyclines, macrolides and trimethoprim/sulfamethoxazole showed poor activity (18.6%-31.1%). EUCAST breakpoints indicated >90% susceptibility to high-dose ceftriaxone and penicillin, moxifloxacin and high-dose levofloxacin. Lower susceptibility to other cephalosporins and aminopenicillins was observed with EUCAST versus CLSI or PK/PD breakpoints. Most H. influenzae isolates (91.8%) were β-lactamase negative; 13 and 5 were β-lactamase-negative ampicillin-resistant following EUCAST and CLSI criteria, respectively. Antibiotic susceptibility was ≥84.8% (CLSI) for all antibiotics except trimethoprim/sulfamethoxazole (23.4%). Susceptibility by EUCAST was similar, except for cefuroxime (oral) with no susceptible isolates versus 95.3% by CLSI and ≤29.8% versus ≥85.4% for fluoroquinolones. CONCLUSIONS: Some therapeutic options against S. pneumoniae and H. influenzae from CA-RTI in India remain, but only ceftriaxone covers both bacterial species using both guidelines. Continued surveillance of antibiotic susceptibility is important to monitor changes and trends in susceptibilities and for guiding empiric therapy of CA-RTIs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».