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Enregistrement W4416690592 · doi:10.1645/24-57

Natural History Collections are Needed to Resolve Host Sampling Gaps in Parasitology: Insights from Avian Haemosporidians

2025· article· en· W4416690592 sur OpenAlexaboutno aff
Spencer C. Galen

Notice bibliographique

RevueJournal of Parasitology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBird parasitology and diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiodiversityHost (biology)Parasite hostingSpecies richnessSampling (signal processing)Avian malariaPlasmodium (life cycle)Natural history

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The field of parasitology, and thus biodiversity research more broadly, is faced with the unfortunate reality that our understanding of parasite biodiversity can be only as good as our ability to sample parasite host species. Although the sampling of many host species is trivial, there typically remains a subset of species across any host group of interest that is difficult to sample due to rarity, habitat, body size, or some other trait. The result is a blind spot in our understanding of parasite biodiversity that is centered around parasite species that infect hosts that are rarely sampled by humans. However, for many groups of hosts, the daunting task of obtaining host samples has already been done, and these samples exist in the form of natural history collections at institutions across the world. With avian malaria parasites and other haemosporidians as an example, I demonstrate that significant host sampling gaps exist in the United States and Canada. Bird species that have not been sampled for molecular haemosporidian research typically are associated with aquatic habitats, significantly greater masses, and more restricted geographic distributions than are bird species that have already been sampled. These unsampled host species are likely to be infected with a high richness of previously undiscovered avian haemosporidian genetic lineages. However, natural history collections in the United States can be used to nearly completely address these sampling gaps with tissue samples currently housed in these institutions. The result of this analysis indicates that the future of parasite biodiversity research is dependent on the use and support of natural history collections and other biorepositories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,155
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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