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Enregistrement W4416701865 · doi:10.1016/j.chom.2025.11.002

Environmental and maternal imprints on infant gut metabolic development

2025· article· en· W4416701865 sur OpenAlexaff
Kine Eide Kvitne, Celeste Allaband, Jennifer C. Onuora, Daniela S. Perry, Simone Zuffa, Lucas Patel, Vincent Charron‐Lamoureux, Ipsita Mohanty, Kristija Sejane, Abubaker Patan, Abdullah Al Mahmud, Tahmeed Ahmed, Diego G. Bassani, Antonio González-Torres, Davidson H. Hamer, Rashidul Haque, Benjamin Ho, Md. Iqbal Hossain, Mohammad Shahidul Islam, Daniel McDonald, Lisa G. Pell, Huma Qamar, Daniel Roth, Samir K. Saha, Prakesh S Shah, Md Muniruzzaman Siddiqui, Shafiqul Alam Sarker, Shamima Sultana, Sydney P. Thomas, Lindsey A. Burnett, Shirley M. Tsunoda, Lars Bode, Pieter C. Dorrestein, Rob Knight

Notice bibliographique

RevueCell Host & Microbe · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of TorontoCentre for Global Health ResearchHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of General Medical SciencesUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésMetabolomeFecesMicrobiomeGut floraFGF19Gut microbiomeImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Early life is a critical period for immune and metabolic development, but these patterns remain underexplored in populations from low- and middle-income countries. Here, we profile the microbiome and metabolome of 55 Bangladeshi mother-infant dyads over the first 6 months of life. Importantly, we observe an increase in microbially derived bile amidates and N-acyl lipids with age in conjunction with reads matching the bile salt hydrolase/transferase (bsh) gene. Although microbial source tracking confirms maternal fecal seeding, a substantial environmental contribution is also highlighted. Differences in infant fecal metabolic profiles are associated with delivery mode, maternal milk composition, household assets, and household-level water treatment. Cesarean section (C-section) delivery and untreated drinking water are linked to transient metabolic differences, including increases in bile amidates, N-acyl lipids, and other host-microbe co-metabolic products, including acylcarnitines. Multi-omics analysis reveals specific microbial-metabolite relationships, highlighting how early environmental and maternal living circumstances influence gut metabolic development through the microbiome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,411
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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