Screening for SCA27B in a cohort of Brazilian patients with unsolved ataxias
Notice bibliographique
Résumé
Spinocerebellar Ataxia 27B (SCA27B) is a recently described autosomal dominant neurodegenerative disease, prevalent in Europe and North America, but not yet properly investigated in Latin America. It is caused by a heterozygous trinucleotide repeat expansion (GAA) >300 in FGF14 gene. Since it is an expansion disorder, diagnosis requires specific molecular techniques. In this scenario, the aim of this study is to screen a large cohort of adults with unsolved ataxias for SCA27B. To date, 108 patients with ataxia were recruited, including patients negative for SCA1,2,3,6,7 and 8. DNA was extracted from peripheral blood and analyzed using different PCR techniques. Initially, long-range PCR (LR-PCR) was used to exclude patients with two alleles within the normal repeat range, 90 patients were negative for FGF14 expansion and eighteen patients showing only one allele in normal size range. Repeat-primed PCR was carried out to identify the expansion and in five out of the 18 analyzed patients the expansion pattern was detected (4.6%). The phenotype was a late-onset slowly progressive ataxia in all cases, with paroxysmal symptoms in 3/5 and pyramidal signs in 1/5. None of them had sensory manifestations. The mean age at onset was 55 years. Our results are consistent with previous publications, which showed that SCA27B ataxia presents initial symptoms at an advanced age and has slow progression. The prevalence of SCA27B we found (4.6%) was much smaller than in French Canadian (61%) and European (18%) cohorts. In conclusion, LR-PCR followed by RP-PCR is a reliable and fast approach to diagnose SCA27B. The phenotype of Brazilian patients with SCA27B is similar to previous reports, however considering that most of the patients included in this study have unsolved ataxia, often with distinct clinical manifestation, the frequency is much smaller. Further studies are needed to understand the genetic epidemiology of this new disease beyond Europe and North America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».