A rapid time-resolved host gene expression signature predicts responses to antibiotic treatment in neonatal bacterial sepsis
Notice bibliographique
Résumé
Sepsis is a leading cause of mortality and morbidity in neonates yet remains difficult to diagnose. This leads to widespread empiric antibiotic therapy, which can facilitate the development of antimicrobial resistance. How the dysregulated host response to infection and sepsis evolves after antibiotic treatment is poorly understood. Temporal gene expression in neonates with microbiologically confirmed sepsis, treated with the antibiotic vancomycin as part of a randomized controlled trial, was profiled to reveal a treatment-responsive gene signature. The signature exhibited a rapid reversal of the septic state, observable within 24 hours of the initiation of therapy. Unexpectedly, response rates associated with the adaptive immune system were among the fastest, and these changes were reproduced in both pediatric and adult patients with sepsis, indicating conservation and reversibility of sepsis signatures across the life course. We demonstrated how these treatment-responsive genes could be translated into a prognostic clinical measure, exhibiting strong agreement with clinical assessments. Network modeling of sepsis-responsive genes identified a signature associated with treatment comprising an early transient elevation of antimicrobial defensive genes, suggesting an impaired bactericidal response in neonatal sepsis. These findings suggest that the host response is regulated in sepsis and offer insights into early prognostic approaches for reducing antibiotic overuse.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».