MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4416719656 · doi:10.1016/j.cbd.2025.101697

Short-term and persistent changes to the muscle transcriptome of Lake sturgeon (Acipenser fulvescens) following early-life exposures to elevated temperatures

2025· article· en· W4416719656 sur OpenAlexafffund
William S. Bugg, Matt J. Thorstensen, Alyssa M. Weinrauch, Catherine Brandt, Ken M. Jeffries, W. Gary Anderson

Notice bibliographique

RevueComparative Biochemistry and Physiology Part D Genomics and Proteomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of ManitobaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaManitoba HydroUniversity of Manitoba
Mots-clésTranscriptomeEpigeneticsSturgeonMuscle tissueDevelopmental biologyTransgenerational epigeneticsEnergy expenditureGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In fishes, environmental change during early development may impact performance later in life. Exposure to elevated temperatures during these periods may result in a variety of changes to organismal physiology including both short-term and persistent impacts to growth. However, the underlying mechanisms which promote these physiological changes are unclear. In this study, we used mRNA-seq of white muscle tissue to investigate mechanisms underlying short-term (3 vs. 6 months post-hatch) and persistent (3 vs. 13 months post-hatch) impacts of temperature (16 °C, 18 °C, and 20 °C) during early development, which underlie enhanced growth performance in young of year lake sturgeon. Functional analysis of differentially expressed transcripts revealed that in the short-term, elevated temperatures of 20 °C had impacts on transcriptional regulation of epigenetic mechanisms, neuron development, muscle structure and function, and energy supply. Further, persistent effects led to the establishment of increased growth, altered muscle phenotypes, and transcriptional changes to alternative splicing, neuron signaling, as well as muscle type and function. Taken together, these results suggest that at 20 °C, epigenetic modifications may lead to a molecular switch inducing neuromuscular junction proliferation, which in turn alters developmental trajectories by increasing lake sturgeon muscle development and growth. These findings are pertinent to hatchery management processes and the impacts of increasing temperatures in natural environments such as from heat waves during early development, which both may have persistent impacts on the developmental trajectory of fishes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,320
Score d'incertitude au seuil0,475

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueComparative Biochemistry and Physiology Part D Genomics and ProteomicsMême sujetPhysiological and biochemical adaptationsTravaux en français237 207