MicroRNA identification and expression analysis of wheat thermo-sensitive male sterile line BNS366 for fertility transformation
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Thermo-sensitive male sterile lines are the key element in the two-line hybrid system of wheat; some specific microRNAs (miRNAs) are involved in the development of anthers in plants, being an important cause of male sterility. Bai-Nong Sterility 366 (BNS366) is an excellent material for the study of thermo-sensitive male sterility, but no information is available on the role of miRNAs in regulating fertility in BNS366. Methods In this study, miRNAs in the pollen mother cell periods and the tetrad periods of the low-temperature sterile and normal fertile anthers of BNS366 were characterized using RNA sequencing (RNA-seq). Results MiRNA sequencing identified 22 differentially expressed known miRNAs and eight novel miRNAs with the largest differential expression folds. The prediction of target genes of the 30 miRNAs yielded 25 target genes, which were highly expressed in wheat spike, and mainly regulated by 13 miRNAs. Gene Ontology (GO) analysis showed that these target genes mainly related to DNA replication and transcription. Five miRNAs (miR9662a, miR5062, miR9662b, miR9653a, and miR9672b) showed opposite expression patterns with their respective potential target genes in BNS366 anther of different fertility. TraesCS5D02G192700 is a potential target gene for miR5062 and encodes an argonaute protein, which functions in meiotic prophase germ cell development and maintenance of meiosis. Conclusion Our findings suggest that the miR5062-argonaute module may plays a pivotal role in the fertility transformation of BNS366. Based on these results, the miRNA-target gene regulatory network involved in the fertility restoration of BNS366 at low temperatures was proposed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».