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Enregistrement W4416795560 · doi:10.1038/s41467-025-65429-0

Plasma lipopolysaccharide levels predict mortality in acutely ill children in Low- and Middle-Income Countries

2025· article· en· W4416795560 sur OpenAlexaff
Christopher Allen, Arya Ghate, James M. Njunge, Lisa Gartner, Abdoulaye Hama Diallo, Christina Lancioni, Ezekiel Mupere, Agnes Gwela, Caroline Tigoi, Benson Singa, Wilson Gumbi, Robert Bandsma, Wieger Voskuijl, Mohammod Jobayer Chisti, Tahmeed Ahmed, Abu Sadat Mohammad Sayeem Bin Shahid, Dilruba Ahmed, Ali Faisal Saleem, Zaubina Kazi, Kelsey Jones, Kirkby D. Tickell, Judd L. Walson, James A. Berkley, Holm H. Uhlig

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNIHR Oxford Biomedical Research CentreWellcome TrustNational Institute for Health and Care ResearchBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésLipopolysaccharideImmune systemWastingContext (archaeology)Lipopolysaccharide binding proteinMicrobiomeAcute-phase proteinSystemic inflammationPathway analysisInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Childhood mortality remains high in low-resource settings, where environmental enteric dysfunction (EED) is prevalent. Peripheral blood bacterial lipopolysaccharides (LPS) are potential biomarkers of intestinal microbial translocation and inflammation; however, the effects of LPS translocation on mortality in this context remains unexplored. We investigate the association between plasma LPS and mortality among 638 acutely ill hospitalised children and compare them to 251 well community peers in a nested case-cohort (NCC) conducted between November 2016 and January 2019 across 9 sites in 6 countries in sub-Saharan Africa and South Asia. Higher levels of plasma LPS and inflammatory biomarkers (fecal calprotectin, plasma myeloperoxidase, and CD14) are associated with elevated 90-day mortality, and those associations are independent of wasting status. Non-survivors with high plasma LPS exhibit elevated gram-negative enteric microbiota, increased fecal biomarkers of EED, systemic inflammatory proteins, and differentially expressed proteins linked to the Insulin-like growth factor (IGF) nutritional axis, Interleukin-1 and collagen regeneration. Cellular interaction network models deconvoluted from a single-cell transcriptomic dataset enable an exploratory investigation of systemic immune responses and epithelial-immune cells crosstalk active in pathways leading to mortality. This knowledge can guide the identification of potential therapeutic signaling pathways in settings with high EED and malnutrition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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