Klossiella equi, an underreported parasite of equids in the Americas
Notice bibliographique
Résumé
Klossiella equi Baumann, 1946 (Apicomplexa: Coccidia) is a globally distributed adeleorinid parasite that infects the kidneys of equid hosts. Considered an uncommon parasite, when K. equi is detected, it is typically an incidental finding during histologic examination of the kidneys as part of routine necropsy. In the present study, kidney was collected opportunistically from 3 different equine populations: 1) routine necropsies at the Ontario Veterinary College (OVC; n = 48); 2) natural mortalities from the Sable Island wild horse herd (n = 25); and 3) routine necropsies of animals from University of Kentucky parasitological research herds (mares n = 3, foals n = 16). A Polymerase Chain Reaction-based method targeting a 575 base pair region of the K. equi mitochondrial genome was developed and applied to DNA extracted from kidney to detect K. equi infections. Overall prevalence was 45% (41/92); no animal < 10 months-of-age was infected. Among animals ≥ 1 year-of-age, prevalence was 58% (40/67) and high at all locations: OVC prevalence of 50% (24/48); Sable Island prevalence of 56% (14/25); and 100% of the mares (3/3) from Kentucky were infected. Twenty of the K. equi-positive cases necropsied at OVC also had routine histological evaluation that failed to detect any K. equi infections. A DNA sample from sporocysts shed in urine by an Argentinian horse was used for sequenced-based genotyping; the resulting sequence matched the K. equi reference (MH203050) at 100% over 957 base pairs. These data confirm that K. equi is grossly underreported and histological evaluation is an insensitive method of detection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».