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Enregistrement W4416815596 · doi:10.1093/ibd/izaf288

Short Ileal Microvillus Length Phenotype Associates with Progression from Inflammatory to Complicated Disease Behavior in Pediatric Crohn’s Disease

2025· article· en· W4416815596 sur OpenAlexaff
Yael Haberman, Tzipi Braun, Rebekah Karns, Courtney A. Bartel, Erin Bonkowski, Katherine F. Simpson, Jeffrey S. Hyams, Ta‐Chiang Liu, Subra Kugathasan, Lee A. Denson, Kelli L. VanDussen

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilWashington University in St. LouisNational Institutes of HealthCincinnati Children’s Research FoundationDigestive Diseases Research Core Center, University of ChicagoIsrael Science Foundation
Mots-clésPhenotypeDiseaseClinical phenotypeMicrovillusBiomarkerInflammatory bowel disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Our previous studies of adult Crohn's disease (CD) suggested ileal microvillus length (MVL) as a prognostic biomarker for therapy response. We investigated if ileal MVL also differed in pediatric CD versus controls and tested for associations with stricturing or penetrating disease behavior outcomes. METHODS: We determined the average ileal MVL of 412 CD and 88 control H&E-stained ileal histology samples from a subset of the RISK cohort and 2 validation cohorts. The RISK sub-cohort had an average follow-up of >60 months and was used to test for associations between ileal MVL and clinical data, RNA-seq molecular profiles, and histopathological scores. RESULTS: Ileal MVL was shorter in CD relative to control (median of 1.396 µm vs. 1.598 µm, respectively). Ileal MVL generally did not associate with demographics or clinical disease activity indices. However, there was a significant association between shorter ileal MVL and increased risk of development of complicated disease behavior. Furthermore, CD samples with shorter ileal MVL showed a significantly shorter time to development of complicated disease behavior. Ileal MVL positively associated with a gene signature enriched for brush border membrane and negatively associated with a gene signature enriched for extracellular matrix, inflamed macrophages, and fibroblasts. Accordingly, ileal MVL was negatively correlated with histopathological scores. CONCLUSIONS: Short ileal MVL is associated with the development of complicated disease behaviors in pediatric CD, supporting the potential use of this histological phenotype as a biomarker for CD prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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