Short Ileal Microvillus Length Phenotype Associates with Progression from Inflammatory to Complicated Disease Behavior in Pediatric Crohn’s Disease
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIMS: Our previous studies of adult Crohn's disease (CD) suggested ileal microvillus length (MVL) as a prognostic biomarker for therapy response. We investigated if ileal MVL also differed in pediatric CD versus controls and tested for associations with stricturing or penetrating disease behavior outcomes. METHODS: We determined the average ileal MVL of 412 CD and 88 control H&E-stained ileal histology samples from a subset of the RISK cohort and 2 validation cohorts. The RISK sub-cohort had an average follow-up of >60 months and was used to test for associations between ileal MVL and clinical data, RNA-seq molecular profiles, and histopathological scores. RESULTS: Ileal MVL was shorter in CD relative to control (median of 1.396 µm vs. 1.598 µm, respectively). Ileal MVL generally did not associate with demographics or clinical disease activity indices. However, there was a significant association between shorter ileal MVL and increased risk of development of complicated disease behavior. Furthermore, CD samples with shorter ileal MVL showed a significantly shorter time to development of complicated disease behavior. Ileal MVL positively associated with a gene signature enriched for brush border membrane and negatively associated with a gene signature enriched for extracellular matrix, inflamed macrophages, and fibroblasts. Accordingly, ileal MVL was negatively correlated with histopathological scores. CONCLUSIONS: Short ileal MVL is associated with the development of complicated disease behaviors in pediatric CD, supporting the potential use of this histological phenotype as a biomarker for CD prognosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».