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Enregistrement W4416816541 · doi:10.1111/ede.70026

Gene Expression Analysis Provides Insights Into the Functional and Developmental Differentiations of Pleopodal Lungs in a Terrestrial Isopod Crustacean, <i>Porcellio scaber</i>

2025· article· en· W4416816541 sur OpenAlexfundno aff
Naoto Inui, A. Yao, Sumio Udagawa, Kohei Oguchi, Yoshinobu Hayashi, Toru Miura

Notice bibliographique

RevueEvolution & Development · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institutes of HealthResearch Organization of Information and Systems
Mots-clésHox geneTranscriptomeGeneGene expressionAppendageVertebrateFunction (biology)Gene expression profiling

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acquisition of air-breathing organs was one of the key events in the diversification of arthropods. Among terrestrial arthropods, isopod crustaceans have evolved a unique air-breathing structure called the pleopodal lung, which is located in their abdominal appendages (pleopods), while retaining pleopodal gills. These lungs offer an intriguing model for studying the evolution of respiratory organs during arthropod terrestrialization. However, the molecular mechanisms underlying lung function or development in isopods remain poorly understood. In this study, we conducted comparative transcriptomic analyzes using the common rough woodlouse, Porcellio scaber, in which pleopods with and without lungs are adjacent to each other. The results revealed distinct gene expression profiles linked to the structure and function of pleopods, including genes involved in morphogenesis. In particular, candidate lung development regulatory genes that were expressed specifically in the exopods of the second pleopods during the manca 1 stage were identified. Transcriptome analysis and immunohistochemistry suggested that the Hox gene abdominal-A is involved in lung formation. However, the two genes previously implicated in respiratory organ formation in pancrustaceans, trachealess and ventral veins lacking, did not show lung-related expression. Our comparison of gene expression patterns between exopods with and without lungs suggest that the function of gas exchange in the pleopodal lungs may be influenced by structural differences resulting from changes in developmental processes. Overall, this study provides essential insights into the molecular mechanisms underlying pleopodal lung development and sets the foundation for future evolutionary research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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