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Enregistrement W4416823359 · doi:10.1093/jacamr/dlaf226

Performance of direct-from-blood culture bottle rapid phenotypic antimicrobial susceptibility testing for Gram-negative bacteremia at a children’s hospital

2025· article· en· W4416823359 sur OpenAlexafffund
Etsuro Nanishi, Aaron Campigotto, Manal Tadros

Notice bibliographique

RevueJAC-Antimicrobial Resistance · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesHospital for Sick Children
Mots-clésAntimicrobial stewardshipBacteremiaAntimicrobialPhenotypeAntibioticsBlood culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Rapid and accurate antimicrobial susceptibility testing (AST) is essential for managing Gram-negative bacteraemia. However, a major limitation of conventional phenotypic AST is its slow turnaround time, delaying targeted therapy. Objectives To evaluate the performance and turnaround time of direct-from-blood culture AST using an automated phenotypic system in paediatric patients with Gram-negative rod bacteraemia. Methods We retrospectively reviewed 135 positive blood cultures with Gram-negative rods from a tertiary paediatric hospital between January 2021 and December 2023. Blood cultures that yielded polymicrobial organisms were excluded from the study. Direct AST was performed by preparing bacterial suspensions directly from positive blood culture broth and analyzed using an automated phenotypic AST system (BD Phoenix™ M50). Conventional AST from isolated colonies served as the reference. Essential agreement (EA), categorical agreement (CA), and error rates [very major error (VME), major error (ME), minor error (mE)] were assessed. Time to AST result was compared between methods. Results The direct AST method reduced the median turnaround time by 24.0 h compared with conventional AST (P < 0.0001). Overall EA and CA were 99.5% and 99.6%, respectively. No VMEs were observed. ME and mE rates were low at 0.25% and 0.25%, respectively, with discrepancies tending to indicate greater resistance by direct AST. Conclusions Direct-from-blood culture AST using an automated phenotypic system provides rapid, accurate susceptibility results in paediatric Gram-negative bacteraemia. This approach enables earlier reporting and may improve clinical outcomes and antimicrobial stewardship without additional resource burden.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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