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Enregistrement W4416852973 · doi:10.1038/s44318-025-00656-1

Ubiquitin pathway blockade reveals endogenous ADP-ribosylation marking PARP7 and AHR for degradation

2025· article· en· W4416852973 sur OpenAlexaff
Andrii Gorelik, Nina Đukić, Rebecca Smith, Chatrin Chatrin, Osamu Suyari, Jason D. Matthews, Ivan Ahel

Notice bibliographique

RevueThe EMBO Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésUbiquitinUbiquitin ligaseAryl hydrocarbon receptorCrosstalkProtein degradationEndogenyUbiquitin-conjugating enzymeSignal transductionUbiquitin-Protein LigasesF-box protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ADP-ribosylation is an important protein post-translational modification catalysed by a family of PARP enzymes in humans and is involved in DNA damage and immunity among other processes. While poly-ADP-ribosylation has been established as a protein degradation signal in several cases, the role of mono-ADP-ribosylation in protein turnover has remained elusive and mostly relies on overexpression systems. Here, we describe a way to visualise high levels of endogenous ADP-ribosylation by inhibiting the ubiquitin pathway. By blocking ubiquitylation/proteasome, we found that ADP-ribosylation by at least three different PARPs (PARP7, PARP1 and TNKS) can be greatly induced. We discovered that specific activation of the aryl hydrocarbon receptor (AHR) pathway in combination with the ubiquitin pathway inhibition promotes quantitative ADP-ribosylation of PARP7 targets, including the mono-ADP-ribosyltransferase PARP7 itself and AHR. We found that DTX2 is the E3 ligase responsible for degrading ADP-ribosylated PARP7, AHR and other PARP7 substrates. This PARP7-DTX2 crosstalk establishes a mechanism to rapidly shut down AHR-mediated transcription by decreasing its protein levels. Taken together, our findings uncover a paradigm where mono-ADP-ribosylation acts as a degradation mark.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,226
Score d'incertitude au seuil0,339

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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