Clinical relevant Bruton’s X-linked tyrosine kinase deficiency in a female with extreme X-chromosome inactivation
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: X-linked agammaglobulinemia (XLA) is an inborn error of immunity resulting from mutations in the BTK gene. It is an X-linked inherited disease that almost exclusively affects males, while females are usually carriers of the disease. However, certain genetic conditions can lead to XLA disease expression in females. We report a 14-year-old girl who was diagnosed with XLA from a pathogenic BTK variant and skewed X chromosome inactivation (XCI). CASE PRESENTATION: A 14-year-old female Ukrainian refugee was referred to the respirology clinic at the Montreal Children's Hospital with an abnormal chest radiograph found during her immigration medical screening process in Canada. She was reported to be previously well until the age of 11 years when she was diagnosed with pneumonia following SARS-CoV-2 infection. She subsequently developed recurrent pneumonias, persistent productive cough, and chronic sinusitis with polyposis. Laboratory investigations showed severely reduced serum immunoglobulin G, A, and M concentrations of 0.78 g/L, < 0.10 g/L, and 0.21 g/L, respectively. Flow cytometry for lymphocyte subsets showed a complete absence of circulating B cells in peripheral blood. Next-generation sequencing panel for inborn errors or immunity revealed a heterozygous pathogenic variant in BTK (c.862C > T, p.Arg288Trp). Analysis of XCI revealed markedly skewed inactivation (99:1), resulting in predominant expression of the mutant pathogenic BTK allele. These findings support the clinical diagnosis of X-linked agammaglobulinemia manifesting in a female patient due to skewed XCI. CONCLUSIONS: Female carriers of pathogenic mutations in BTK may develop clinically important disease as a result of extreme random X inactivation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».