A prognostic model for uveal melanoma in Asian populations: a comparative analysis of clinical features and gene expression patterns using the TRACE and TCGA data
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Uveal melanoma (UM), the most common primary intraocular malignancy in adults, shows racial disparities in incidence, genetic drivers, and clinical outcomes. While most prognostication models are based on Caucasian populations, Asians demonstrate distinct molecular profiles, necessitating population-specific risk stratification. METHODS: This study analyzed 53 Asian UM tumors, 17 normal choroidal tissues (TRACE database), and 80 Caucasian UM samples (TCGA database). Differential gene analysis, immune microenvironment profiling, and survival modeling were performed. A 7-gene prognostic signature was developed by LASSO regression and validated across cohorts, with drug sensitivity predicted using GDSC2 data. RESULTS: The Asian UM exhibited 3,827 tumor-specific differentially expressed genes (DEGs) compared to the normal choroid, with enrichment in PI3K-Akt signalling, and 3,814 race-specific DEGs compared to Caucasians, suggesting specific disease pathways and variations in the tumor microenvironment. The tumor microenvironment in Asian UM exhibited increased immunological activation (M1 macrophages, PD-L1, CD8; p < 0.05), while Caucasian uveal melanoma was marked by immunosuppressive predominance (M2 macrophages, MDSCs). The seven-gene prognostic model (MMP2, LRAT, NOG, IHH, CDH18, MYH11, and SELE) exhibited strong predictive efficacy in Asians (AUC: 0.979, 0.924, and 0.984 for 1, 3, and 5-year survival) but was less successful in Caucasians. High-risk scores correlated with metastasis (12/26 vs. 4/27; p = 0.02) and had independent prognostic value. CONCLUSIONS: This cross-racial UM study reveals significant molecular and immune differences, indicating that Asian UM may be more responsive to immunotherapy The population-specific prognostic model improves our understanding of molecular differences in Asian and Caucasian UM, warranting further validation in multiethnic cohorts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».