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Enregistrement W4416934974 · doi:10.21203/rs.3.rs-8192243/v1

Soil microbial diversity and network organization respond to land use and agricultural inputs worldwide

2025· preprint· W4416934974 sur OpenAlexaff
Zaki Saati‐Santamaría, Sergio Pérez-Gorjón, Daniel Abel‐Schaad, Alberto Acedo-Bécares, Francisca Alba‐Sánchez, Amanda Alves, Weronika Babińska-Wensierska, Carolina Barroetaveña, Karen Barry, Francisco J. Beitia, Katerina Biniari, Elí Misael Bobadilla-Peñaló, Gregory Bonito, Mihalis Boutaris, Victoria Bueno-González, Guillermo Cabezas, Parharidis Charalambos, Ovidiu Copoț, Andrés de Errasti, Luis de Pedro, Philippe Delavault, Fernando Diánez, David Diez‐Méndez, Enrico Ercole, Abel Fernández Ruiz, Martina Ferraguti, Ana L. Gallo, Paula García‐Fraile, Mario Garrido, Alina G. Greslebin, Gabriel Grilli, Edmundo Danilo Guilcapi-Pacheco, Danny Haelewaters, Terry W. Henkel, Andrés Hirigoyen, Kentaro Hosaka, Pablo Yair Huais, Marja Jalli, Alfredo Justo, Marjo Keskitalo, Tommaso La Mantia, Aneta Lambevska-Hristova, Ewald Langer, Corina Leconte, Ewa Łojkowska, David Marcos-Vidal, Antonio J. Mendoza‐Fernández, Isabel Miralles, Lucía Molina, Norman Muzhinji, Minh N. Nguyen, Diego Nieto‐Lugilde, Alberto Nieto-Palenzuela, André-Ledoux Njouonkou, Francisco J. Oficialdegui, Raúl Ortega, Ansa Palojärvi, Marcos Paradelo, Zunilda Pavone, Julio Peñas de Giles, Anna Maria Persiani, María Belén Pildain, Daniel Pinto Carrasco, Lucie Poulin, Jean‐Bernard Pouvreau, Paola Quatrini, David Rodríguez de la Cruz, Gonzalo M. Romano, Natalia Rosas‐Ramos, Francisca Ruano, Isabel Salcedo-Larralde, Esteban Salmerón‐Sánchez, Kateřina Sam, Cathy Sharp, Patrícia Vieira Tiago, Ricardo Valenzuela, Aída M. Vasco‐Palacios, Mylonas Vasilis, María Laura Vélez, Alfredo Vizzini, Sergey Volobuev, Alan R. Wood, Pirjo Yli‐Hemminki, Nourou S. Yorou, Ivan V. Zmitrovich, Javier Bobo‐Pinilla

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2025
Typepreprint
Langue
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesEuropean Social FundMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesAgencia Estatal de InvestigaciónHORIZON EUROPE Framework ProgrammeEuropean CommissionEuropean Regional Development Fund
Mots-clésAgricultureEcosystemBiomeBiodiversityLand useEcosystem servicesSoil biodiversityOrganic farmingDiversity (politics)Microbial population biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soil microbiomes are critical for ecosystem functioning, yet the global influences of climate and agricultural practices on their diversity and structure remain incompletely characterized. Here we analyzed 1921 soil samples from 33 countries worldwide across diverse biomes to assess how climate gradients and agricultural inputs, including pesticides and fertilizers, shape prokaryotic and fungal communities. We found that microbial diversity peaks at intermediate temperatures and differs markedly between natural and agricultural soils, with agriculture increasing microbial diversity while altering community composition and ecological guilds. Pesticide use selectively reduced bacterial diversity and shifted fungal guilds, decreasing ectomycorrhizal fungi while increasing saprotrophs, whereas fertilization reduced microbial network cohesion, with organic and inorganic fertilizers eliciting distinct community responses. These findings reveal that climatic factors and agricultural management jointly influence soil microbial diversity, community structure, and network connectivity, with implications for soil health and ecosystem resilience in managed landscapes. Overall, our results demonstrate that agricultural practices, including the use of pesticides and both organic and inorganic fertilizers, act as strong ecological filters that reshape soil microbiomes worldwide-enhancing apparent diversity but driving a functional shift toward less mutualistic, more fragmented, and potentially less resilient communities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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