Common genetic polymorphisms define one-carbon metabolite responses to different forms of choline in healthy adult males
Notice bibliographique
Résumé
Background Responsiveness to nutrients can be determined by many types of variations, such as single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Choline is an essential nutrient critical for proper organ function and exists in different forms, such as free choline or as derivatives, including phosphatidylcholine (PC). Although genetic variations in genes encoding enzymes that influence choline metabolism have been identified, little is known regarding individual responses to free choline and PC in relation to SNPs. Here, we determined the effect of different forms of choline, genotype, and their interaction on one-carbon metabolite concentrations in urine, which has utility in capturing the overall change in choline metabolism. Methods A randomized, double-blinded, crossover study was conducted in healthy adult males ( n = 37) who were provided with a standardized meal containing 600 mg choline, either as choline bitartrate (CB) or PC, or no choline (NC). Urine was collected at study baseline and pooled throughout the 6-h study duration. Choline dehydrogenase ( CHDH ) rs12676, betaine-homocysteine S-methyltransferase ( BHMT ) rs3733890, choline kinase alpha ( CHKA ) rs10791957, and phosphatidylethanolamine N-methyltransferase ( PEMT ) rs4646343 were genotyped. Results There was a main treatment effect for urinary choline change from baseline, reflective of differences in absorption by free choline versus PC ( p < 0.01). A reduction in responsiveness to CB was found with genetic variation in CHDH rs12676, manifested as lower choline oxidation ( p < 0.05), and downstream pathways in the methionine cycle ( p < 0.01), whereas a reduction in responsiveness to PC occurred with genetic variation in BHMT rs3733890 ( p < 0.05). Genetic variations in CHKA rs10791957 and PEMT rs4646343 reflected differences in the partitioning of choline in response to CB and PC ( p < 0.01). Multivariate analysis showed that groups with an accumulated number of effect alleles across all SNPs have contrasting responses to CB and PC that deviate from the patterns derived from treatment effect alone ( p < 0.05). Conclusion Unique metabolite signatures in one-carbon metabolism arise in response to supplemental intake of different forms of choline, driven by genetic variations that regulate choline homeostasis. Our findings highlight the importance of nutrient–gene interactions in deciphering the complexity of individual metabolic responses, supporting the emerging concept of precision nutrition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».