Epigenetic and blood markers associated with response to electroconvulsive therapy in patients with depressive disorders
Notice bibliographique
Résumé
Electroconvulsive therapy (ECT) is an effective antidepressant treatment. The mechanisms behind the therapeutic effect are not fully understood, and reliable biomarkers for response are needed. Epigenetic modifications, such as DNA methylation (DNAm), can reflect both genetic and environmental impacts; they may shed light on the mechanisms behind treatment effects and they have the potential to inform response prediction. We performed an epigenome-wide association study (EWAS) in peripheral blood from patients before and after ECT in a Norwegian cohort (n = 65). The methylation levels of 12 differentially methylated CpG positions (DMPs) and 18 differentially methylated regions (DMRs) were significantly associated with percent clinical response. In addition, 29 DMPs and 23 DMRs were significantly associated with remission (Montgomery and Åsberg Depression Rating Scale MADRS < 10 post treatment). Two DMRs were also significantly associated with percent response at baseline and four DMRs were significantly associated with remission at baseline (FDR < 0.05). We did not identify any longitudinal (pre-post) changes in DNAm. We further performed the first meta-analysis (n = 99) between ECT cohorts, combining this Norwegian cohort and a German ECT cohort (n = 34). Seven of the DMRs found to be associated with response in the meta-analyses were previously identified in the Norwegian or the German cohort (FDR < 0.05). Methylation risk scores (MS) calculated using DMPs associated with ECT in the Norwegian cohort showed promising association with response to ECT in the German cohort (p = 0.06). Finally, we found increased neutrophil to lymphocyte ratios, calculated from estimated cell proportions, to be associated with remission (p < 0.003) in the Norwegian cohort.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».