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Enregistrement W4417015485 · doi:10.5376/lgg.2025.16.0007

Genome-Wide Identification of WRKY Transcription Factors in Chickpea and Their Roles in Stress Responses

2025· article· W4417015485 sur OpenAlexvenueno aff
Deming Yu, Shengyu Chen

Notice bibliographique

RevueLegume Genomics and Genetics · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWRKY protein domainTranscription factorTranscriptomeAbiotic stressGeneIdentification (biology)Gene expression profilingPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

WRKY transcription factors play pivotal roles in regulating plant responses to various biotic and abiotic stresses. In this study, a comprehensive genome-wide identification and analysis of WRKY transcription factors were conducted in Cicer arietinum  (chickpea), a key legume crop with growing importance in stress biology. Using advanced bioinformatics tools, we identified and annotated the complete set of WRKY  genes in the chickpea genome, classifying them into groups I, II, and III based on conserved domains and structural features. The chromosomal distribution, gene structures, and phylogenetic relationships were analyzed to provide insights into their evolutionary patterns. Expression profiling under drought, salinity, and pathogen stress conditions (e.g., Fusarium and Ascochyta) revealed several stress-responsive WRKY  genes with distinct tissue-specific and developmental expression patterns. We further explored their regulatory networks, including interactions with key signaling molecules (ABA, JA, SA) and crosstalk with other transcription factor families. A detailed case study highlighted the role of selected WRKY  genes in drought tolerance, supported by phenotypic assessments under water-deficit conditions. Functional validation through overexpression, gene silencing, and omics approaches-such as transcriptomics and CRISPR/Cas-based editing-provided strong evidence for the functional roles of specific WRKY  genes. This study underscores the significance of WRKY transcription factors in stress adaptation and sets the foundation for their application in marker-assisted selection and breeding of stress-resilient chickpea varieties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,166
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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