Spatial Transcriptomics of Cotton Fibers During Elongation Stage
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Cotton fiber development plays a vital role in the global textile economy, and the elongation stage is crucial in determining fiber length and quality. In this study, we employed spatial transcriptomics to uncover the spatial organization of gene expression during the elongation phase of Gossypium hirsutum fibers. By integrating spatial barcoding and high-resolution transcriptomic mapping, we localized fiber-specific gene expression domains and identified elongation-zone-enriched transcripts. Our analysis revealed expression gradients of GhEXPA1 , GhRDL1 , and GhMYB25 -like along fiber tips, highlighting region-specific transcriptional modules associated with cell wall remodeling, ROS scavenging, and energy metabolism. These findings provide functional insights into the spatial coordination of molecular pathways underlying fiber elongation. This study not only demonstrates the power of spatial transcriptomics in dissecting complex developmental processes but also lays a foundation for future applications in targeted breeding, genome editing, and molecular improvement of cotton fiber quality.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle