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Enregistrement W4417017348 · doi:10.5376/cmb.2025.15.0013

Genomic Biomarker Discovery for Drug Sensitivity Using Omics Data

2025· article· W4417017348 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueComputational Molecular Biology · 2025
Typearticle
Langue
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug responseOmicsPrecision medicineDrug discoveryDrugPersonalized medicineDrug developmentBiomarker discoveryBiomarker

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drug sensitivity refers to the differences in the degree of response of different individuals or cells to drugs. Revealing its molecular mechanism is crucial for achieving individualized and precise treatment. However, the average efficacy rate of the anti-cancer drugs approved by the FDA among patients is only about 40%, indicating that the traditional "one-size-fits-all" treatment model is difficult to meet the diverse needs of patients. The development of omics technology has made it possible to conduct a global analysis of biomarkers related to drug responses. By integrating multi-level data such as genomics, transcriptomics, and proteomics, genomic markers closely related to drug sensitivity can be systematically screened out, thereby predicting patients' responses to specific drugs and guiding clinical medication. This study starts from the basic concepts and molecular mechanisms of drug sensitivity, reviews the application of omics data in drug response research, methods and algorithms for genomic marker screening, as well as common data resources, and conducts a case analysis of multi-omics marker screening taking the anti-cancer drug EGFR inhibitor as an example, discussing the current challenges and limitations. Finally, the development direction of precise drug response prediction driven by artificial intelligence is prospected. This study aims to provide a reference for mining drug sensitivity biomarkers using omics data, promoting precision medicine and new drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,489
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle