MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4417017348 · doi:10.5376/cmb.2025.15.0013

Genomic Biomarker Discovery for Drug Sensitivity Using Omics Data

2025· article· W4417017348 sur OpenAlexvenueno aff
Jiayi Wu

Notice bibliographique

RevueComputational Molecular Biology · 2025
Typearticle
Langue
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug responseOmicsPrecision medicineDrug discoveryDrugPersonalized medicineDrug developmentBiomarker discoveryBiomarker

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drug sensitivity refers to the differences in the degree of response of different individuals or cells to drugs. Revealing its molecular mechanism is crucial for achieving individualized and precise treatment. However, the average efficacy rate of the anti-cancer drugs approved by the FDA among patients is only about 40%, indicating that the traditional "one-size-fits-all" treatment model is difficult to meet the diverse needs of patients. The development of omics technology has made it possible to conduct a global analysis of biomarkers related to drug responses. By integrating multi-level data such as genomics, transcriptomics, and proteomics, genomic markers closely related to drug sensitivity can be systematically screened out, thereby predicting patients' responses to specific drugs and guiding clinical medication. This study starts from the basic concepts and molecular mechanisms of drug sensitivity, reviews the application of omics data in drug response research, methods and algorithms for genomic marker screening, as well as common data resources, and conducts a case analysis of multi-omics marker screening taking the anti-cancer drug EGFR inhibitor as an example, discussing the current challenges and limitations. Finally, the development direction of precise drug response prediction driven by artificial intelligence is prospected. This study aims to provide a reference for mining drug sensitivity biomarkers using omics data, promoting precision medicine and new drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueComputational Molecular BiologyMême sujetComputational Drug Discovery MethodsTravaux en français237 207