Genetic predispositions in children with primary immunodeficiency and lymphoma: Experience from king hussein cancer center
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Primary immunodeficiencies (inborn errors of immunity) confer susceptibility to recurrent infections and malignancies—particularly B-cell lymphomas—due to immune surveillance deficits and poor control of oncogenic viruses such as Epstein-Barr virus. Moreover, lymphoma arising in a PID patient complicates management, making treatment challenging and necessitating tailored chemotherapy and vigilant supportive care. Methods: In this retrospective single-center study, we identified 17 pediatric patients with lymphoma and concurrent primary immunodeficiency. All patients met ≥1 criterion of the McGill Interactive Pediatric OncoGenetic Guidelines (MIPOGG) for cancer predisposition and were referred to our Pediatric Cancer Predisposition Clinic. Each patient underwent targeted next-generation sequencing using a primary immunodeficiency gene panel. Lymphoma subtype, specific immunodeficiency diagnosis, and survival status were recorded alongside any treatment modifications (dose reductions, prophylaxis). Clinical data, genetic findings, and outcomes were analyzed descriptively. Results: Seventeen children (10 males, 7 females) with primary immunodeficiency and lymphoma were identified, including 7 Hodgkin lymphoma (HL) and 10 non-Hodgkin lymphoma (NHL) cases. The median age at lymphoma diagnosis was 8 years (range 2–17). Pathogenic or likely pathogenic homozygous variants were identified in four genes—ATM (n=2 patients), DCLRE1C (Artemis, n=3), RASGRP1 (n=1), and STK4 (n=1). The remaining 10 patients carried variants of uncertain significance in the following genes: ITK (n=3), RASGRP1 (n=1), TNFRSF9 (CD137, n=1), DOCK8 (n=1), FOXI3 (n=1), PLCG2 (n=1), IRF8 (n=1), and PIK3CD (n=1). These genetic findings corresponded to a range of primary immunodeficiency disorders, from severe combined immunodeficiencies (e.g., Artemis-SCID) and DNA repair disorders (Ataxia-Telangiectasia) to immune dysregulation syndromes (e.g., activated PI3K-delta syndrome and PLCG2-associated PLAID). Most patients received reduced-intensity chemotherapy protocols due to their immunodeficiency, along with supportive therapy such as monthly intravenous immunoglobulin (IVIG), antimicrobial prophylaxis, and rituximab for Epstein-Barr virus reactivation. Despite these measures, outcomes were poor: at last follow-up, only 7 of 17 patients (41%) were alive in remission (3 of 7 HL and 4 of 10 NHL), while 10 had died (mostly from infections). Conclusion: Survival for children with lymphoma and PID was worse than for immunocompetent patients. Our findings underscore the need to screen newly diagnosed pediatric lymphoma cases for underlying immunodeficiency (especially in consanguineous families or those with recurrent infections). Early identification enables tailored chemotherapy, infection prophylaxis, and timely transplantation to improve outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».