The Roles of Life History and Mating System in Speciation: Genomic Evidence From the <i>Incarvillea sinensis</i> Complex
Notice bibliographique
Résumé
The temporal sequence and mechanistic interplay between life-history and mating-system transitions in plants remain poorly understood. Here, we combine crossing experiments with population genomic analyses to investigate these processes in the Incarvillea sinensis complex (Bignoniaceae), which contains annual selfing and perennial outcrossing populations. Crossing experiments revealed complete post-zygotic isolation between annuals and perennials. Genomic data derived from de novo assemblies of annual and perennial individuals, along with SNP and chloroplast sequencing of 126 individuals from 30 populations, demonstrated strong genetic divergence between life histories, with no evidence of contemporary gene flow between them. Compared to perennials, annuals exhibited significantly reduced genetic diversity, elevated differentiation and a greater number of chromosomal rearrangements-particularly translocations. Divergence time estimates indicated that annual and perennial lineages split during the early Pleistocene (ca. 2.22 Mya), whereas the shift to selfing from outcrossing within the annual lineage was a more recent event, occurring during the late Pleistocene (~0.03 Mya). These results indicate that the mating-system shift was not the initial driver of divergence, and we infer that the life-history transition likely occurred earlier, although its precise timing could not be directly determined. Our findings support a two-stage model of divergence in which adaptation to seasonally arid environments first drove the evolution of annuality, initiating speciation through ecological isolation and genetic divergence. The subsequent evolution of selfing then likely further promoted reproductive isolation via both pre- and post-zygotic mechanisms, potentially accelerating rapid genomic differentiation and effectively completing the speciation process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».