Global Salivary Proteomic Profiling of Individuals with the Co-Occurrence of Type 2 Diabetes Mellitus, Dyslipidemia, and Periodontitis
Notice bibliographique
Résumé
Human whole saliva contains informative proteins related to disease processes and is important for oral cavity homeostasis. The aim of this study was to investigate the global salivary proteomic profile, including functional enrichment analysis of individuals affected by combinations of poorly/well-controlled type 2 diabetes mellitus (T2DM), dyslipidemia (DL), and periodontitis (P) for the identification of potential disease biomarkers. Biochemical and periodontal evaluations were performed on 150 subjects divided into five groups according to disease combinations. Unstimulated saliva was collected, and proteomic analysis was performed using Liquid Chromatography Electrospray Ionization Tandem Mass Spectrometry (LC-ESI-MS/MS). Results were obtained by searching for the Homo sapiens database of the UniProt catalog using Proteome Discoverer 1.3. PANTHER GO-Slim (PANTHER version 19.0), and Cytoscape 3.10.1 (extensions Metascape) were used to access biological pathways. A total of 1762 proteins were identified in saliva samples. The proteomic profile of T2DM-DL-P groups (G1-poorly controlled T2DM; G2-well-controlled T2DM) were the most diverse and functionally enriched. In G1 and G3, the most abundant protein was TTN, with ENO-1 being highly enriched and associated with the aerobic glycolysis pathway and PFN1 associated with a pro-inflammatory environment. PFN1 was highly enriched in (G1) AKIRIN-2 (immune response), and in (G2) KMT2A (epigenetic regulation) and CALML3 (DNA metabolism and repair). For (G4), the highest abundant protein was RIMS-1, with VIRMA (cytoskeletal organization) being the most enriched. The global salivary proteomics analyses demonstrated significantly altered protein profiles in each group of different pathological combinations, providing new insights into their biology and identifying potential diagnostic and therapeutic candidates for these diseases of growing global concern.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».