Genetic diversity hotspots of trematodes (Platyhelminthes) in Mexico and their overlap with protected natural areas
Notice bibliographique
Résumé
Genetic diversity (GD) is a fundamental component of biodiversity that remains largely overlooked in conservation planning, especially for parasitic taxa. Trematodes are among the most diverse and ecologically important parasitic groups, although their GD across regions remains poorly characterized. Here we analyze the nucleotide diversity (π) and haplotype diversity (Hd) of mitochondrial (COI) and nuclear (28S) genes using sequences available in public datasets to: (i) represent the spatial patterns genetic diversity at the family level of trematodes across Mexican biogeographic provinces and Protected Natural Areas (PNAs); (ii) identify regions with the highest GD (hotspots); and (iii) to explore how environmental factors influence genetic diversity patterns. We identified some GD patterns, as well as GD hotspots in center and southeastern Mexico, particularly in the states of Michoacán, Estado de México, Veracruz, Tabasco, Chiapas, and Oaxaca. Correlation and model selection analysis revealed multiples environmental variables that can influence the GD of trematodes, as temperature seasonality (BIO4), max temperature of warmest month (BIO5), annual temperature range (BIO7), precipitation of the wettest quarter (BIO16), precipitation of warmest quarter (BIO18) and vegetation type. Furthermore, we found that 37 of 67 PNAs in the southeast overlapped with cells mapped with high-GD, suggesting that existing PNAs may preserve GD. However, public databases are still limited, highlight the need to promote more targeted studies that include parasitic taxa in conservation initiatives. This work contributes to the integration of genetic indicators into biodiversity monitoring, in line with the objectives of the Kunming-Montreal Global Biodiversity Framework.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».