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Enregistrement W4417089744 · doi:10.1038/s41598-025-30627-9

Fibre orientations in collagen-containing tissues revealed with computational scattered light imaging and polarimetric second harmonic generation microscopy

2025· article· en· W4417089744 sur OpenAlexafffund
Loes Ettema, Viktoras Mažeika, Mehdi Alizadeh, Hamed Abbasi, Virginijus Barzda, Miriam Menzel

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueOptical Coherence Tomography Applications
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLietuvos Mokslo TarybaDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésMicroscopyPolarimetryTendonSecond-harmonic generationOrientation (vector space)HarmonicCollagen fibresResolution (logic)Similarity (geometry)Ultrastructure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collagen forms dense fibre networks in the human body, with the organisation directly influencing tissue mechanics and function in health and disease. A good understanding of this relation requires proper imaging techniques for visualising the dense collagen network. Previously, computational scattered light imaging was employed as a fast and easy-to-implement technique to retrieve the orientations of multi-directional fibres in various tissue samples, but the fibre orientations were not yet validated quantitatively in regions containing collagen fibres. In this study, we validate the in-plane orientations of fibres in collagen-containing tissues (rat tendon and bone sections) determined with computational scattered light imaging by performing comparative measurements with polarimetric second harmonic generation microscopy. For rat tendon, sections with and without hematoxylin-and-eosin staining, folded tendon layers, and obliquely cut sections were investigated. Similar fibre orientations were obtained with both techniques in both tissues, with the highest degree of similarity found for in-plane, unidirectional fibres in the tendon sections. The techniques were able to retrieve the orientations of multi-directional crossing fibres in folded rat tendon layers, and results were found to be unaffected by staining. While polarimetric second harmonic generation microscopy provides high resolution and ultrastructural information on collagen, computational scattered light imaging provides large field of view measurements with micrometre resolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,198
Score d'incertitude au seuil0,529

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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