Distinct 5′ UTR Requirements for Translation of the Bicistronic X/P mRNA Among Avian Orthobornaviruses
Notice bibliographique
Résumé
Orthobornaviruses express X and the phosphoprotein (P) from a bicistronic X/P mRNA, and these proteins regulate polymerase activity. In mammalian orthobornaviruses, the 5' untranslated region (5' UTR) of the X/P mRNA controls the translational balance between X and P and thereby promotes efficient replication. Avian bornaviruses (ABVs) belong to two clades, clade-2 and -3, that differ in the structure and length of the 5' UTR of the X/P mRNA. However, the functional consequences of these differences remain unclear. Using reverse genetics, we generated chimeric viruses by reciprocally exchanging the 5' UTR of the X/P mRNA among clade 2 parrot bornavirus 5 (PaBV-5) and aquatic bird bornavirus 1 (ABBV-1) and clade 3 PaBV-4. In PaBV-5, a long 5' UTR with a stem-loop and an upstream ORF was required to maintain the X-to-P translational balance. On the other hand, replacing the 5' UTR of the X/P mRNA from PaBV-5 with that from PaBV-4 reduced X expression and markedly impaired viral growth. However, PaBV-4 tolerated the 5' UTR of the X/P mRNA from PaBV-5 without detectable effects on translation or replication, which suggests that translation of PaBV-4 X/P mRNA does not depend on the origin of the 5' UTR. Furthermore, ABBV-1 replicated efficiently with the 5' UTR of the X/P mRNA from PaBV-5 but was strongly attenuated with that from PaBV-4. Taken together, these results demonstrate a clade-dependent requirement for the 5' UTR for translation of the X/P mRNA and provide novel insights into the evolution of translational control in orthobornaviruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».