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Enregistrement W4417103596 · doi:10.1111/1348-0421.70031

Distinct 5′ UTR Requirements for Translation of the Bicistronic X/P mRNA Among Avian Orthobornaviruses

2025· article· en· W4417103596 sur OpenAlexaff
Meng‐Chi Wu, Takehiro Kanda, Ryo Komorizono, Madoka Sakai, Alexander Leacy, Leonardo Susta, Akiko Makino, Keizō Tomonaga

Notice bibliographique

RevueMicrobiology and Immunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMessenger RNAFive prime untranslated regionUntranslated regionTranslation (biology)Three prime untranslated regionTranslational efficiencyTranslational regulationPhosphoproteinAU-rich element

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Orthobornaviruses express X and the phosphoprotein (P) from a bicistronic X/P mRNA, and these proteins regulate polymerase activity. In mammalian orthobornaviruses, the 5' untranslated region (5' UTR) of the X/P mRNA controls the translational balance between X and P and thereby promotes efficient replication. Avian bornaviruses (ABVs) belong to two clades, clade-2 and -3, that differ in the structure and length of the 5' UTR of the X/P mRNA. However, the functional consequences of these differences remain unclear. Using reverse genetics, we generated chimeric viruses by reciprocally exchanging the 5' UTR of the X/P mRNA among clade 2 parrot bornavirus 5 (PaBV-5) and aquatic bird bornavirus 1 (ABBV-1) and clade 3 PaBV-4. In PaBV-5, a long 5' UTR with a stem-loop and an upstream ORF was required to maintain the X-to-P translational balance. On the other hand, replacing the 5' UTR of the X/P mRNA from PaBV-5 with that from PaBV-4 reduced X expression and markedly impaired viral growth. However, PaBV-4 tolerated the 5' UTR of the X/P mRNA from PaBV-5 without detectable effects on translation or replication, which suggests that translation of PaBV-4 X/P mRNA does not depend on the origin of the 5' UTR. Furthermore, ABBV-1 replicated efficiently with the 5' UTR of the X/P mRNA from PaBV-5 but was strongly attenuated with that from PaBV-4. Taken together, these results demonstrate a clade-dependent requirement for the 5' UTR for translation of the X/P mRNA and provide novel insights into the evolution of translational control in orthobornaviruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,576
Score d'incertitude au seuil0,212

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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