Passive environmental and group-level processes drive gut microbiome composition in a wild corvid
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The gut microbiome is known from laboratory studies to be essential to host function and sociality, yet comparatively little is known about this association in wild animals. In wild birds, the gut microbiome seems to be broadly driven by environmental factors, and there is mixed evidence for a link with sociality. Here, we describe the gut microbiome composition of the Siberian jay (Perisoreus infaustus), a highly social group-living and food-caching corvid of the Eurasian boreal forest. RESULTS: We present evidence of potential environment-related variation in the gut microbiome of wild Siberian jays. Environmental acquisition of microbes may be an important process shaping their gut microbiome composition based on similarities to the local environmental microbial community, for which we propose an environment–oral–gut route as a potential underlying mechanism. We also identify an unexpected group-level convergence, wherein social horizontal transmission of gut microbes may be an incidental consequence of reciprocal cache pilfering among group members. CONCLUSIONS: While the ecological significance of gut microbiome variation in Siberian jays is still unclear, our results paint a picture of passive microbiome assembly resulting from a combination of environmental acquisition and social transmission in a wild bird species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».