Cosmic silence and viral noise: transcriptomic crosstalk in <i>Caenorhabditis elegans</i> under simulated space conditions
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Spaceflight environments pose unique physiological challenges due to altered gravity and radia-tion exposure. To investigate how these abiotic stressors interact with viral infection, we analyzed the transcriptomic response of Caenorhabditis elegans acclimated to simulated microgravity (µG) and below-background muon radiation flux (BBR), upon infection with Orsay virus (OrV). Using RNA-seq, we characterized gene expression profiles across single and combined stress condi-tions. Both µG and BBR elicited distinct stress responses, including modulation of oxidative stress, lipid metabolism, and immune pathways. OrV infection alone induced robust transcrip-tional changes, but its impact was significantly attenuated when combined with either abiotic stress, suggesting antagonistic interactions. Notably, proviral genes such as drl-1 , fat-7 and hipr-1 were downregulated under BBR and µG, potentially impairing viral replication. Gene ontology analyses revealed enrichment in immune effectors, RNA metabolism, and proteostasis-related pathways, particularly under BBR. Viral load and RNA2/RNA1 ratios were reduced in both stress conditions, indicating a shift in viral replication dynamics. Moreover, genomic diversity and de-fective viral genome formation were differentially affected, with increased genetic diversity and structural variation under stress. These findings suggest that acclimation to off-Earth conditions primes the host for a dampened response to an acute viral infection, potentially through resource reallocation and transcriptional attenuation. This study provides transcriptomic insight into viral infection under space-relevant conditions, highlighting complex stress interactions and their im-plications for host-pathogen dynamics in extraterrestrial environments.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».