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Enregistrement W4417121067 · doi:10.3390/genes16121468

Artificial Intelligence-Driven Design of Antisense Oligonucleotides for Precision Medicine in Neuromuscular Disorders

2025· article· en· W4417121067 sur OpenAlexafffund
Jamie Leckie, Sunny Z. Wu, Terryanne Standell, Toshifumi Yokota

Notice bibliographique

RevueGenes · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensMuscular Dystrophy CanadaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchMuscular Dystrophy CanadaUniversity of AlbertaAlberta Innovates - Health SolutionsWomen and Children's Health Research InstituteChildren's Health Research InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésTranslation (biology)Precision medicineOligonucleotideExon skippingExonTranslational research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rare neuromuscular disorders impose a significant burden on patients, caregivers, and the health care system, yet, effective disease-modifying therapies remain limited. Antisense oligonucleotides (ASOs) have emerged as a promising therapeutic strategy, enabling targeted modulation of gene expression through mechanisms such as exon skipping, exon inclusion, and transcript degradation. However, the clinical efficacy of currently approved ASO therapies is often suboptimal. This limitation reflects not only poor target tissue uptake and delivery barriers, but also suboptimal design of ASO sequences and chemical modification patterns, which can compromise potency, safety, and translational robustness. Recent advances in machine learning have led to the development of ASO optimization platforms such as eSkipFinder and ASOptimizer, which aim to predict effective ASO sequences and chemistries for specific RNA targets. While these tools show considerable promise, their broader applicability remains limited due to a lack of comprehensive validation and the absence of integrated safety considerations. Further refinement and validation are necessary to improve their translational utility. Nevertheless, such platforms represent a critical advancement toward accelerating ASO development. By improving design precision, reducing reliance on extensive preclinical screening, and enabling researchers with limited ASO experience to generate optimized candidates, machine learning is poised to accelerate the development and clinical translation of ASO therapies for rare neuromuscular disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,701
Score d'incertitude au seuil0,458

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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