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Enregistrement W4417136500 · doi:10.5670/oceanog.2025.e402

Ten Pressing Questions (and Answers) About Marine Fungi and Opportunities for Collaborations in the Ocean Sciences

2025· article· W4417136500 sur OpenAlexfundno aff
Anthony S. Amend, Nina Gunde‐Cimerman, Marco A. Coelho, Colleen A. Durkin, Cassandra L. Ettinger, Hugh Gifford, Amy Gladfelter, Cene Gostinčar, Lior Granit, Igor V. Grigoriev, Marcelo H. Gutiérrez, K. C. D. Hickman, T.L. James, Adam Jones, Márcia David‐Palma, Xuefeng Peng, C. Alisha Quandt, Teppo Rämä, Lluvia Vargas‐Gastélum, Syrena Whitner, Audrey M. Williams, Oded Yarden, Anne Yenewodage, Geoffrey Zahn

Notice bibliographique

RevueOceanography · 2025
Typearticle
Langue
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesLawrence Berkeley National LaboratoryDivision of Ocean SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilUniversity of ExeterOffice of ScienceAgencia Nacional de Investigación y DesarrolloMedical Research Council Centre for Medical MycologyCanadian Institute for Advanced ResearchJoint Genome InstituteGordon and Betty Moore FoundationU.S. Department of EnergyNational Institutes of HealthScience Foundation IrelandNational Science Foundation
Mots-clésMarine fungiMarine lifeMarine researchMarine ecosystemMarine biologyEcosystem

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nearly 200 years have passed since the first marine fungus, collected from the shores of North Africa, was described. In that time, marine mycologists have continued to observe, describe, and study fungi in every marine ecosystem examined. Nevertheless, fungi remain functionally “dark matter” of the ocean, presenting a grand opportunity to unravel their roles in ecosystem processes. This report outlines the discussion among participants of the second occasional meeting of marine mycologists at Asilomar, California, in March 2024, in which a diverse and interdisciplinary consortium of researchers enumerated the most pressing, and often basic, unanswered questions in marine fungi. We report on the questions facing the field of marine mycology, identify challenges in addressing those questions, and propose concrete and practical solutions for obtaining their answers. A common thread is the need for increasing cross talk and collaboration between mycologists and oceanographers that would present opportunities for readers to participate in a rapidly growing field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,065
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0650,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0230,031
Communication savante0,0250,035
Science ouverte0,0030,019
Intégrité de la recherche0,0150,016
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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