Multiomics integration uncovers metabolic control of H3K27ac in bovine inner cell masses
Notice bibliographique
Résumé
The epigenetic reprogramming that occurs during the early stages of embryonic development has been described as crucial for the initial events of cell specification and differentiation, with possible long-term consequences to the offspring. This investigation explores the link between pyruvate metabolism and epigenetic regulation by culturing bovine embryos from Day 5 in the presence of sodium dichloroacetate (DCA), an organic acid that enhances the conversion of pyruvate to acetyl-CoA, and sodium iodoacetate (IA), which inhibits glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), leading to the inhibition of glycolysis. Both treatments led to changes in the levels of H3K27 acetylation as well as their resulting binding patterns across the chromatin in the inner cell masses of blastocysts. An integrative analysis was performed between the molecular data and the results of chromatin state for H3K27ac. DCA led to a more robust association with biological processes related to lipid metabolism, while IA presented a higher binding activity linked to processes such as apoptosis and catabolism. The results discussed here corroborate previous evidence of the relationship between energy metabolism and epigenetic reprogramming in preimplantation bovine embryos, pointing to H3K27ac as an important mark for the immediate response of embryos to environmental changes in culture systems.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».