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Enregistrement W4417170627 · doi:10.1073/pnas.2519119122

Globally aggregated biodiversity data impact predictive and descriptive research

2025· article· en· W4417170627 sur OpenAlexaff
Dirk Steinke, Birgit Gemeinholzer, Enrique Martínez‐Meyer, Daniel Noesgaard, Andrew Young, Dmitry Schigel

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoCommonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
Mots-clésBiodiversityGlobal biodiversityDiversification (marketing strategy)Thematic mapBig dataMeasurement of biodiversityEnvironmental dataResource (disambiguation)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Here, we present an analysis of the growth and use of the Global Biodiversity Information Facility (GBIF) over the last 5 y. GBIF is the world's largest data integrator for biodiversity information and plays a central role in research across the biodiversity and evolutionary science community. With the help of a comprehensive bibliographic dataset comprising 12,193 studies that used GBIF-mediated data, we demonstrate how the global scientific community utilizes the continuously fast-growing amount of open and Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable biodiversity data in their research. Overall, more researchers engage with GBIF data, a potential consequence of the rising demands of more global environmental assessments, where GBIF-mediated data are being used as a key resource for biodiversity research. Studies utilizing species distribution modeling were most prevalent and data used for topics related to challenges of the Anthropocene (conservation, climate change, invasive, and pest species). More studies used observational data records, a category that also includes a substantial amount of citizen science data. Our data show that a thematic diversification of GBIF-using literature is accompanied by a rapid diversification of both the additional datasets that GBIF data are analyzed with, as well as the new analytical approaches taken by researchers. This emphasizes the growing importance of GBIF's data infrastructure and services which support global sciences and reflect major shifts in applied science which dictate the need for GBIF and similar data infrastructures to evolve rapidly in order to maintain relevance for research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,039
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,156
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,204

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0390,156
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0200,043
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0120,015
Science ouverte0,0020,008
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,164
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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