Evaluation of Sex-Stratified Polygenic Risk Scores for Type 2 Diabetes Mellitus and Glycemic Traits in the Framingham Heart Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGRUOUND: Diabetes is a multifactorial disease with significant genetic predisposition. Polygenic risk scores (PRS) have been developed to estimate an individual's genetic risk of a disease. Traditionally, PRS utilize sex-combined genome-wide association studies (GWAS) due to the limited availability of sex-stratified summary statistics. This study explores sex-dimorphic genetic effects and evaluates the potential benefits of incorporating sex-stratified effects in PRS for type 2 diabetes mellitus (T2DM) and glycemic traits by comparing PRS performance derived from sex-combined versus sex-stratified GWAS. METHODS: We performed a sex-heterogeneity test across sex-specific GWAS and identified nine signals with sex-dimorphic effects for T2DM. PRS[sex-combined] and PRS[sex-stratified] were developed using sex-combined and sex-stratified GWAS results for T2DM (41,444 cases and 354,539 controls), fasting glucose (n=120,595) and fasting insulin (n=98,210). We evaluated these PRS models in 8,379 participants (1,303 cases and 7,076 controls) from the Framingham Heart Study not included in the PRS derivation. RESULTS: Our findings suggest that sex-combined PRS currently offer better predictive performance for T2DM and glycemic traits. CONCLUSION: These results highlight the need for larger sex-stratified studies and the optimization of sex-stratified risk models for clinical practice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,035 | 0,044 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».