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Enregistrement W4417201295 · doi:10.1158/1557-3265.earlyonsetca25-c030

Abstract C030: Effect of palmitic acid exposure in normal colon organoids derived from young versus older individuals

2025· article· en· W4417201295 sur OpenAlexaboutno aff
Casidhe-Nicole Bethancourt, Yosuke Mitani, Michelle Zhang, Tianxia Li, Yoanna S Pumpalova, Beatrice Dionigi, Joel Gabre

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrganoidColorectal cancerMatrigelPalmitic acidCryptRectum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Diet and obesity play a role in the intestinal microenvironment. High-fat diet and metabolic changes associated with obesity has been shown to increased cellular remodeling and local inflammation. Given the rise in early onset colorectal cancer, here we explore the effect of a high-fat environment in colonic organoids derived from young versus older individuals. We propose that organoids derived from younger individuals have more cellular plasticity, allow them to proliferate in high-fat environment at the cost of increased mutational burden and an altered intestinal microenvironment that increases the risk of tumor development and progression. Method: We generated organoids obtained from normal colon tissue from patients undergoing colorectal resection for colon cancer, one £45 years old and the other >60 years old. After sufficient growth, organoids were chemically passaged, counted and seeded at 50,000 cells per 50µl of Matrigel in a 24-well plate. After 2 days of growth in standard organoid media, organoids were treated with 30µM of palmitic acid. Equivalent amounts of ethanol in 1% BSA served as a control. PDOs were examined under Celigo Image Cytometer (Nexcelom) at desired time points to quantify number of organoids per well. Following treatment, RNA was obtained using RNAqueous-Micro Kit and then converted to cDNA using Bio-Rad kit. qRT-PCR Bio-Rad was conducted using iCycler RT–PCR detection system. Results: A high-fat environment led to significantly increased organoid formation in normal colon organoids in £45YO group but not in the >60YO group (mean number of organoids 245 versus 314 in £45YO-control and £45YO-exposed respectively; p-value<0.0001 and 167 versus 197 in >60YO-control and >60YO-exposed respectively; p-value 0.0892). After 96hr of growth, this significant difference was lost. Following passage and despite adjustment to normal organoid media, the £45YO-exposed group had significantly increased organoid formation capacity compared to control (mean number of organoids 94 versus 182 in £45YO-control and £45YO-exposed; p-value=0.006). TLR4 gene expressions levels were quantified and found to be significantly increased by exposure to PA in the <45YO group but not the >60YO group (p-value 0.0299). Conclusion: Using palmitic acid, a known component of a high-fat diet, we demonstrate that exposure leads to increased proliferation in colonic organoids derived from young individuals but not older individuals. Despite normalization of the environment, the second generation of organoids derived from those exposed demonstrated continued proliferation compared to control. TLR4 gene expression was also significantly increased in this group. This receptor likely may modulate inflammation in the tumor microenvironment. Citation Format: Casidhe-Nicole R. Bethancourt, Yosuke Mitani, Michelle Zhang, Tianxia Li, Yoanna Pumpalova, Beatrice Dionigi, Joel Gabre. Effect of palmitic acid exposure in normal colon organoids derived from young versus older individuals [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: The Rise in Early-Onset Cancers—Knowledge Gaps and Research Opportunities; 2025 Dec 10-13; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2025;31(23_Suppl):Abstract nr C030.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,105
Tête enseignante GPT0,497
Écart entre enseignants0,393 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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