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Enregistrement W4417203600 · doi:10.32350/cto.51.05

In silico Evaluation of the Inhibitory Potential of Novel Hybrid Efflux Pump Inhibitors against Mycobacterium tuberculosis

2025· article· W4417203600 sur OpenAlexaff
Karim Raza

Notice bibliographique

RevueCurrent Trends in OMICS · 2025
Typearticle
Langue
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensBombardier (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEffluxIn silicoMycobacterium tuberculosisDocking (animal)Multiple drug resistanceTuberculosisBinding affinitiesIn vitroDrug resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tuberculosis (TB) is an infectious condition caused by Mycobacterium tuberculosis. One of the key steps towards introducing infectious disease in control is the creation and application of antibiotics. M. tuberculosis strain is multidrug resistant, which is a major threat to TB control. It develops multidrug resistance (MDR) by using efflux pumps (EPs) and other associated systems that can reduce the efficacy of the drug. Several techniques are currently developed to overcome the efflux-mediated resistance and the development of efflux pump inhibitors (EPIs) is one of them. The current study aims to provide an in-silico evaluation of biologically validated hybrid efflux pump inhibitors (HEPIs) with different M. tuberculosis EP proteins. Twelve different HEPIs were identified through literature review. Docking analysis was used to examine the role of HEPI inhibition against 5 MDR EPs. Additionally, the absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) of all hybrid EP inhibitors were assessed. Molecular docking indicated that several HEPIs, specifically 5, 7, and 11, showed persistent higher binding affinities across multiple proteins, with docking scores comparable to or better than already known inhibitors. The predicted ADMET profiles suggested that most inhibitors had good oral bioavailability and adequate safety margins. To conclude, these HEPIs have the ability to effectively inhibit TB in human beings. In this regard, HEPI-5, HEPI-7, and HEPI-11 were determined as the most promising inhibitors because of their high binding affinities and positive ADMET profiles. Although experimental validation is essential to confirm their therapeutic relevance, these findings highlight their potential as novel EPI scaffolds. However, some of their pharmacological properties are not appropriate for human beings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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